Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcr5Q04683 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cxcr5Q04683 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cxcr5Q04683 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Cxcr5Q04683 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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