Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnb1Q03717 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms