Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2BP78356 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms