Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shox2P70390 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shox2P70390 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shox2P70390 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shox2P70390 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shox2P70390 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms