Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd13P70217 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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