Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTG2P63267 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTG2P63267 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms