Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms