Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp1P58466 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms