Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms