Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa8P50706 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms