Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp2P29594 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp2P29594 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms