Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn10P28658 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn10P28658 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms