Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd10P28359 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hoxd10P28359 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hoxd10P28359 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hoxd10P28359 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hoxd10P28359 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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