Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms