Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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