Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vpreb2P13373 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms