Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RngttO55236 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RngttO55236 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RngttO55236 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RngttO55236 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RngttO55236 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RngttO55236 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RngttO55236 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RngttO55236 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms