Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms