Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf212F6TQD1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf212F6TQD1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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