Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga8A2ARA8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms