Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms