Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx4Q9QY61 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms