Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cbx8Q9QXV1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms