Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms