Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard6bQ9JK83 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms