Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms