Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem27Q9ESG4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem27Q9ESG4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms