Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trpv4Q9EPK8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv4Q9EPK8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv4Q9EPK8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv4Q9EPK8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv4Q9EPK8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trpv4Q9EPK8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms