Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc94Q9D6J3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms