Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chordc1Q9D1P4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms