Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms