Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhobtb3Q9CTN4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms