Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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