Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms