Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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