Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc115Q8VE99 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc115Q8VE99 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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