Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul7Q8VE73 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul7Q8VE73 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms