Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin52Q8CD94 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms