Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim19Q80ZU4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms