Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TwistnbQ78WZ7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TwistnbQ78WZ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms