Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ubfd1Q78JW9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubfd1Q78JW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubfd1Q78JW9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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