Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sycp1Q62209 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sycp1Q62209 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms