Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc8bQ5DU41 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms