Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f8Q58FA4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f8Q58FA4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms