Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt35Q497I4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt35Q497I4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms