Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc33Q3ULW6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc33Q3ULW6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms