Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc102aQ3TMW1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms