Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms