Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux2P70298 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux2P70298 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms