Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms